Les premiers résultats de la plus grande étude jamais réalisée sur le microbiome humain sont enfin disponibles. Ces résultats ont des implications significatives pour nos pratiques alimentaires, la résistance aux antibiotiques et même notre santé mentale.
En 2012, Rob Knight, Ph.D., de l’Université de Californie à San Diego, Jeff Leach, Ph.D., fondateur du Human Food Project, et Jack Gilbert, Ph.D., directeur du centre de microbiome à l’Université de Chicago, ont lancé un projet ambitieux pour étudier le microbiome humain.
L’objectif était d’approfondir notre compréhension de cette collection de gènes, qui codent pour tous nos microbes. Les chercheurs voulaient déterminer le nombre de types de bactéries vivant dans notre corps, leur localisation, ainsi que l’impact de notre alimentation et de notre mode de vie sur la composition de ces microbes.
Pour y parvenir, ils ont mis en œuvre la science citoyenne, permettant au grand public de participer à la recherche en offrant leur temps et leurs données personnelles pour analyse.
Les premiers résultats du projet sont désormais accessibles, offrant des aperçus précieux sur ce qui contribue à maintenir notre intestin en bonne santé. Ces résultats ont été publiés dans un journal scientifique reconnu.
Des Scientifiques Citoyens au Service de l’Étude du Microbiome
Dans le cadre du projet, les participants ont versé 99 $ pour acquérir une trousse permettant de recueillir des échantillons de bactéries provenant de leurs selles, de leur bouche et de leur peau.
Ils ont également répondu à un questionnaire sur leur état de santé général, les maladies antérieures, leur mode de vie et leurs habitudes alimentaires.
En 2015, le projet comptait 15 096 échantillons fournis par 11 336 personnes aux États-Unis, au Royaume-Uni, en Australie et dans 42 autres pays.
Les chercheurs ont utilisé le séquençage génomique pour analyser un marqueur génétique appelé ARNr 16S, qui est spécifique aux bactéries.
En outre, ils ont examiné l’ensemble des métabolites présents dans les échantillons, afin d’analyser d’autres molécules et composés chimiques potentiellement présents.
Enfin, une méthode innovante, la métagénomique de fusil de chasse, a été utilisée pour effectuer une analyse exhaustive des données génétiques.
L’Importance d’une Alimentation Végétale Diversifiée
Les résultats indiquent qu’une alimentation riche en plantes, diversifiée et variée, est bénéfique pour la diversité bactérienne de l’intestin.
Plus précisément, les participants consommant plus de 30 types différents de plantes par semaine avaient des microbiomes nettement plus diversifiés que ceux ayant une consommation limitée à 10 types ou moins.
Cependant, les chercheurs mettent en garde : une plus grande diversité microbienne ne garantit pas nécessairement une meilleure santé.
Deuxièmement, ceux qui ont rapporté une consommation élevée de plantes semblaient également présenter une résistance réduite aux antibiotiques, avec moins de gènes associés à cette résistance dans leurs échantillons fécaux.
Bien que l’étude soit purement observationnelle, les auteurs suggèrent que ceux dont l’alimentation est pauvre en plantes pourraient compenser par une consommation accrue de viande, souvent traitée avec des antibiotiques, ou d’aliments transformés contenant des antibiotiques.
Bactéries Intestinales et Santé Mentale
L’étude a également révélé des liens fascinants entre la composition bactérienne intestinale et la santé mentale.
Les participants souffrant de troubles tels que le stress post-traumatique (SSPT), la schizophrénie, la dépression ou le trouble bipolaire ont été comparés à des témoins sains, appariés par âge, sexe et indice de masse corporelle (IMC).
Les résultats ont montré que ceux ayant des problèmes de santé mentale partageaient un profil bactérien plus similaire entre eux que par rapport aux témoins sains.
Cette association s’est maintenue indépendamment du sexe, de l’âge ou de la localisation géographique. De plus, certaines bactéries semblent plus fréquentes chez les personnes atteintes de dépression.
Ces découvertes renforcent les liens établis par des études antérieures sur la santé mentale et le microbiome intestinal.
Par exemple, une recherche récente a mis en lumière une corrélation entre l’anxiété et la carence de certains microbes intestinaux bénéfiques. Une autre étude a révélé des altérations bactériennes chez des individus souffrant de SSPT.
Vers un « Microbiome GPS »
Daniel McDonald, Ph.D., directeur scientifique de l’American Gut Project, souligne l’importance de ces résultats. Il déclare :
« Nous avons observé une diversité microbienne beaucoup plus importante que celle trouvée dans des études antérieures, ce qui indique que si nous élargissons notre échantillon à d’autres populations, nous découvrirons une diversité encore plus riche, cruciale pour définir les limites du microbiome humain. »
Rob Knight partage ce sentiment : « Le microbiome humain est complexe. Plus nous aurons d’échantillons, plus rapidement nous pourrons comprendre les multiples façons dont le microbiome est lié à divers états de santé et de maladie. »
« L’American Gut Project est dynamique, recevant des échantillons du monde entier chaque jour », ajoute Knight.
« L’analyse présentée dans ce document représente un instantané unique, mais notre objectif est d’aller au-delà de la simple cartographie du microbiome, pour créer un véritable microbiome GPS, capable de vous indiquer non seulement votre position sur cette carte, mais aussi la direction à prendre pour améliorer votre santé, que ce soit par le biais de votre alimentation, de votre style de vie ou de médicaments. »
Rob Knight, Ph.D.
Recherche et Perspectives Futures
Les recherches sur le microbiome continuent d’évoluer rapidement, avec des études en cours qui explorent les interactions complexes entre notre alimentation, notre microbiome et notre santé globale. De nouvelles découvertes pourraient potentiellement transformer notre approche des maladies et améliorer notre bien-être général.
À l’avenir, il est essentiel de continuer à surveiller l’impact des différents régimes alimentaires, notamment ceux riches en fibres et en diversité, sur notre microbiome. Cela pourrait nous aider à mieux comprendre comment ces facteurs influencent non seulement notre santé intestinale, mais aussi notre santé mentale et notre résistance aux maladies.
Ainsi, alors que nous avançons dans cette ère de recherche, il est crucial de considérer le microbiome comme un acteur clé de notre santé globale, et d’adopter des habitudes alimentaires qui favorisent un équilibre microbien bénéfique.
