Selles vertes : causes alimentaires et quand consulter

Les selles vertes, chez une personne qui se sent bien, tiennent le plus souvent à l’alimentation ou à un transit trop rapide. La bile, liquide jaune-vert qui aide à digérer les graisses, n’a alors pas le temps de brunir avant d’être évacuée. Toutes les teintes de brun, et même le vert, sont considérées comme habituelles ; le rouge vif et le noir goudronneux, eux, peuvent indiquer du sang et demandent un avis médical sans délai.

Un bol d’épinards, un smoothie vert ou un gâteau au glaçage coloré suffisent parfois à teinter la cuvette dès le lendemain. Ce brun habituel n’est pas un pigment « magique » de l’alimentation. Il dépend surtout d’une enzyme bactérienne, la bilirubine réductase (BilR), identifiée en 2024 dans Nature Microbiology. Dans 1 801 échantillons de microbiote d’adultes en bonne santé, le gène de cette enzyme n’était absent que dans 0,1 % des cas, alors qu’il manque souvent chez le nouveau-né.

Un traitement antibiotique sur cinq s’accompagne d’une diarrhée, qui peut laisser les selles verdâtres le temps que le microbiote se rééquilibre. Les CDC américains conseillent de consulter si une diarrhée dépasse trois jours, si la fièvre dépasse 38,9 °C ou en présence de sang. Des selles pâles, couleur argile, associées à des urines foncées et à une jaunisse, relèvent d’un autre mécanisme, le manque de bile dans l’intestin.

Pourquoi les selles deviennent-elles vertes

Le vert des selles est d’abord celui de la bile qui n’a pas encore été transformée. Le foie produit ce liquide jaune-vert, stocké dans la vésicule, qui émulsionne les graisses. En chemin dans l’intestin, des enzymes et des bactéries le font passer du vert au brun. Quand le contenu intestinal avance trop vite, comme lors d’une diarrhée, cette conversion reste inachevée et la couleur verte persiste.

La bilirubine, pigment issu de la dégradation de l’hémoglobine des globules rouges, suit le même trajet. Conjuguée par le foie, elle rejoint la bile, puis l’intestin. Les bactéries la réduisent en urobilinogène, puis en stercobiline, pigment brun des selles. Hall, Levy et leurs collègues ont montré en 2024 que cette réduction repose surtout sur une enzyme unique, BilR, portée principalement par des bactéries du groupe des Firmicutes. Sans ces bactéries, le pigment reste plus proche du vert-jaune de la bile.

Chez l’adulte en bonne santé, cette fonction est presque universelle. Elle l’est moins chez le nourrisson des premiers mois, période où la jaunisse néonatale est aussi plus fréquente, et moins encore dans les métagénomes de personnes atteintes de maladie de Crohn ou de rectocolite hémorragique. Cela n’autorise pas à lire une maladie inflammatoire dans une selle verte isolée. Cela rappelle seulement que la couleur brune est un travail partagé entre le foie, la bile et le microbiote, et non une constante chimique.

Le vert n’est donc pas, à lui seul, un diagnostic. Il dit que le pigment biliaire n’a pas achevé sa conversion, que des végétaux très chlorophylliens ont coloré le bol alimentaire, ou que les deux se combinent. La durée et les signes associés pèsent plus que la teinte.

Aliments, colorants et compléments de fer

Les légumes verts à feuilles, épinards, chou kale, persil, sont la cause alimentaire la plus banale. Leur chlorophylle traverse en partie le tube digestif et teinte les selles, surtout si la portion a été copieuse. Les colorants verts, bleus ou violets des boissons, glaces, bonbons et glaçages font le même effet, parfois de façon spectaculaire chez un enfant après une fête. Une fois l’aliment éliminé, la couleur habituelle revient.

Le fer oral fonce souvent les selles, jusqu’au vert très sombre ou au noir. Le sous-salicylate de bismuth, utilisé contre la diarrhée dans certains pays, et le charbon activé noircissent aussi le bol. La réglisse noire, les myrtilles et, plus rarement, de grandes quantités de légumes très foncés peuvent imiter un noir alimentaire. Ces teintes ne collent pas et n’ont pas l’odeur fade du méléna, le noir goudronneux du saignement digestif haut. En cas de doute, seul un test de sang occulte, prescrit par le médecin, départage le pigment et le sang.

Les betteraves, le jus de tomate, les canneberges et les colorants rouges peuvent rougir les selles ou l’eau de la cuvette. La distinction avec un saignement n’est pas toujours évidente à l’œil. Si vous n’avez pas mangé d’aliment rouge identifiable, ou si la teinte persiste après deux ou trois selles, le plus sûr est d’en parler au médecin traitant plutôt que d’attribuer le rouge à la cuisine.

Quelques points concrets aident à relier un repas et une couleur.

• Un plat d’épinards ou un smoothie vert le midi peut donner des selles verdâtres dès le lendemain, puis s’effacer.
• Un complément de fer prescrit pour une anémie fonce souvent les selles tant que le traitement dure.
• Un colorant de boisson ou de pâtisserie disparaît en général avec le prochain transit normal.
• La réglisse noire et les myrtilles peuvent noircir les selles sans qu’il s’agisse d’un saignement.

Si vous n’avez ni légumes verts, ni colorant, ni fer, et que le vert se répète plusieurs jours, l’alimentation n’explique plus grand-chose. C’est alors le transit, un médicament ou une infection qu’il faut envisager, avec le médecin.

Diarrhée, gastro-entérite et infections

Une diarrhée accélère le transit. La bile reste verte, les selles deviennent molles ou liquides, parfois verdâtres. Ce n’est pas le germe qui « peint » les selles. C’est la vitesse. Les infections digestives les plus souvent en cause sont virales, bactériennes ou parasitaires. Le tableau clinique, plus que la teinte, oriente le diagnostic.

La salmonellose, infection bactérienne d’origine alimentaire, débute le plus souvent 6 heures à 6 jours après l’exposition. Diarrhée aqueuse, parfois avec du sang ou du mucus, crampes, fièvre. Les symptômes durent en général 4 à 7 jours. Les CDC américains indiquent d’appeler un médecin si la diarrhée ou les vomissements dépassent deux jours, si les selles contiennent du sang, si la fièvre dépasse 38,9 °C ou si des signes de déshydratation apparaissent. La plupart des personnes se rétablissent avec une réhydratation. Chez un adulte sans autre maladie, les antibiotiques ne raccourcissent en général pas la diarrhée et ne sont envisagés que dans des situations précises, selon le médecin.

Le norovirus, première cause de vomissements et de diarrhée aux États-Unis d’après les CDC (données 2024), se déclare 12 à 48 heures après le contact. Diarrhée, vomissements, nausées, douleurs d’estomac, parfois fièvre et courbatures. L’épisode dure en général 1 à 3 jours. Les antibiotiques n’agissent pas sur un virus. Le risque immédiat est la déshydratation, surtout chez le jeune enfant, la personne âgée et les personnes déjà malades. Une solution de réhydratation orale, disponible en pharmacie, remplace mieux l’eau et les sels minéraux qu’une boisson sucrée seule.

La giardiase, infection par le parasite Giardia, commence souvent 1 à 2 semaines après l’ingestion d’eau ou d’aliments contaminés. Diarrhée, gaz, selles nauséabondes, grasses, qui peuvent flotter, crampes, nausées, fatigue. Les symptômes durent typiquement 2 à 6 semaines, parfois plus. Cette infection peut aussi jaunir les selles par malabsorption des graisses, d’après Harvard Health. Le diagnostic repose sur des analyses de selles prescrites par le médecin, qui choisira éventuellement un antiparasitaire selon le résultat et la situation.

Quelques signes associés pèsent plus que la couleur verte.

• Une fièvre élevée, des crampes violentes ou du sang dans les selles sortent du cadre d’un simple « caca vert » alimentaire.
• Une soif intense, une bouche sèche, des urines rares ou très foncées et un vertige au lever évoquent une déshydratation.
• Chez un nourrisson, l’absence de larmes, une fontanelle creusée ou plus de trois heures sans couche mouillée justifient un avis urgent.
• Une diarrhée qui revient par vagues ou qui s’accompagne d’un amaigrissement n’est plus une gastro-entérite banale.

Le médecin traitant, ou le 15 en cas de malaise franc, tranche selon l’ensemble du tableau, pas selon la teinte isolée.

Antibiotiques et bactéries intestinales

Environ une personne sur cinq qui prend un antibiotique développe une diarrhée liée au traitement, d’après la Mayo Clinic (page mise à jour en septembre 2025). Les selles molles apparaissent parfois dès les premières heures, plus souvent en quelques jours, et cessent en général pendant le traitement ou peu après l’arrêt. Parce que les bactéries intestinales participent à la conversion de la bilirubine, un microbiote chamboulé peut aussi laisser les selles verdâtres même sans diarrhée spectaculaire.

Presque toutes les familles d’antibiotiques peuvent être en cause. Celles le plus souvent impliquées comprennent les céphalosporines, les fluoroquinolones, les pénicillines, la clindamycine, les carbapénèmes et les macrolides. Le pharmacien et le médecin connaissent les équivalents commercialisés en France. N’arrêtez pas un antibiotique prescrit sans en parler, même si les selles changent de couleur. Un arrêt trop tôt peut laisser l’infection initiale inachevée.

Une diarrhée plus grave, qui commence parfois plusieurs jours à deux mois après le début du médicament, peut correspondre à une infection à Clostridioides difficile (souvent appelée C. diff). Selles fréquentes, crampes du bas-ventre, petite fièvre, nausées, perte d’appétit, déshydratation. Les personnes de 65 ans et plus, les nourrissons, les personnes hospitalisées ou en établissement, celles qui ont déjà eu une diarrhée sous antibiotique, et celles qui prennent un inhibiteur de la pompe à protons sont plus exposées. Ce n’est pas un « effet indésirable bénin » à attendre chez soi si les selles sont très liquides, s’il y a de la fièvre ou un malaise.

La prévention la plus solide reste d’utiliser les antibiotiques seulement lorsqu’ils sont indiqués. Ils ne soignent pas une angine virale ni une grippe. Se laver les mains après les toilettes et avant les repas limite la transmission de C. difficile et des gastro-entérites. Si une diarrhée sous antibiotique a déjà eu lieu, signalez-le au médecin avant la prochaine prescription. Il pourra parfois choisir une autre molécule.

Rouge, noir, jaune ou blanc, que regarder

Le vert se discute. Le rouge vif, le noir goudronneux et le blanc argile se prennent plus au sérieux, parce qu’ils peuvent signaler du sang ou un défaut de bile. Le tableau ci-dessous reprend les correspondances les plus utiles, d’après la Mayo Clinic (2024), Harvard Health (2024) et MedlinePlus (2024-2025). Une couleur n’est jamais un diagnostic à elle seule.

Le noir alimentaire n’est en général ni collant ni particulièrement fétide. Le méléna, au contraire, est noir, visqueux, d’odeur fade, parce que le sang a été digéré depuis l’œsophage, l’estomac ou le duodénum. MedlinePlus (révision de janvier 2025) classe les selles goudronneuses, un volume important de sang, des vomissements de sang ou en marc de café, un vertige, une douleur thoracique, un essoufflement ou une douleur abdominale intense parmi les situations d’urgence. Aux États-Unis, la consigne est d’appeler les secours. En France, composez le 15 (SAMU) ou le 112.

Le rouge vif sur le papier ou en filet autour de la selle vient souvent d’hémorroïdes ou d’une fissure, surtout s’il y a de la constipation et une douleur à l’exonération. Un saignement plus abondant, un rouge mêlé à la selle, une diarrhée sanglante ou un rouge qui persiste relèvent du médecin, car polypes, maladies inflammatoires, diverticules, angiodysplasie ou cancer peuvent aussi saigner. Un saignement minime mais répété, même sans douleur, mérite un rendez-vous. Les anticoagulants et les anti-inflammatoires non stéroïdiens (ibuprofène, naproxène, aspirine) augmentent le risque de saignement digestif.

Les selles pâles, blanc-gris ou couleur argile, traduisent souvent un manque de sels biliaires dans l’intestin. Une hépatite, des calculs, un rétrécissement ou une tumeur des voies biliaires, une atteinte du pancréas peuvent bloquer l’écoulement. Jaunisse (peau et blanc des yeux jaunes) et urines couleur cola accompagnent fréquemment ce tableau, parce que les pigments biliaires passent dans le sang et l’urine au lieu des selles. C’est un motif de consultation rapide, pas un changement à « attendre que ça passe ».

Le jaune gras qui flotte et sent très fort évoque une stéatorrhée, un excès de graisses dans les selles. Maladie cœliaque, insuffisance pancréatique, obstruction biliaire, parfois giardiase. Un régime très gras peut jouer un rôle, mais une stéatorrhée qui se répète n’est pas une affaire de friture isolée.

Selles vertes chez le nourrisson

Chez le nouveau-né, le vert foncé, presque noir et collant, des premiers jours s’appelle le méconium. C’est attendu. Les selles passent ensuite par une phase de transition verdâtre, puis, chez le bébé allaité, vers un jaune moutarde, parfois légèrement vert. La Mayo Clinic (2024) souligne que le vert n’est pas rare chez le nourrisson allaité et qu’il devient moins habituel, tout en restant rarement inquiétant, chez l’enfant plus grand et l’adulte.

Plusieurs mécanismes propres au nourrisson expliquent un vert persistant. Un allaitement interrompu trop tôt du même sein peut priver l’enfant du lait de fin de tétée, plus riche en graisses, et accélérer le transit. Les préparations à base d’hydrolysats de protéines, utilisées en cas d’allergie aux protéines du lait de vache ou du soja, colorent souvent les selles. Le microbiote du bébé allaité n’est pas encore celui de l’adulte. Une diarrhée, enfin, laisse la bile verte comme chez l’adulte.

La couleur seule ne dit pas si le bébé a une diarrhée. Les selles d’un nourrisson allaité sont souvent molles, granuleuses, fréquentes. C’est le changement brutal, plus de selles beaucoup plus liquides qu’à l’habitude, qui alerte, surtout avec fièvre, vomissements, refus de téter ou signes de déshydratation. Des selles très pâles, presque blanches, chez un nourrisson font craindre un problème hépatique ou biliaire et demandent un avis médical sans attendre. Du sang dans les selles, même en petite quantité, se signale aussi au médecin qui suit l’enfant.

Le pharmacien peut indiquer une solution de réhydratation orale adaptée à l’âge. Le médecin traitant ou le pédiatre reste la référence pour les moins de trois mois, chez qui une gastro-entérite se déshydrate plus vite. N’introduisez pas de médicament antidiarrhéique de votre propre initiative chez un nourrisson.

Consistance des selles et échelle de Bristol

La couleur raconte le pigment. La forme raconte le temps de transit. L’échelle de Bristol classe les selles en sept types, des boules dures séparées (type 1) jusqu’au liquide sans morceau (type 7). Dans une étude de validation de 2016, Blake, Raker et Whelan ont montré que les types 1 et 2 correspondent à des selles dures, les types 3 à 5 à la forme généralement considérée comme normale, et les types 6 et 7 à des selles molles ou liquides. Les volontaires classaient correctement 81 % des modèles, avec davantage d’hésitation aux frontières (types 2, 3, 5 et 6).

Les types 3, 4 et 5 forment donc la zone habituelle, plus large que le seul couple 3-4 souvent cité. Un type 5, selles molles à bords nets, n’est pas à lui seul une diarrhée. Un type 6 ou 7, surtout s’il se répète, l’est davantage. La fréquence habituelle varie beaucoup. Certaines personnes vont à la selle plusieurs fois par jour, d’autres deux fois par semaine. C’est le changement par rapport à votre rythme, plus qu’un chiffre universel, qui compte.

Observer la selle avant de tirer la chasse n’est pas une manie. Notez, si la couleur change, si elle est dure, boudinée, molle ou liquide, avec mucus, sang, douleur ou fièvre. Ces quelques mots aident le médecin plus qu’une photo floue. L’échelle de Bristol est un langage commun, pas un test de laboratoire.

Selles vertes, quand voir un médecin

Des selles vertes isolées, expliquées par un plat de légumes ou un colorant, et qui s’arrêtent en quelques selles, se surveillent à la maison. La Mayo Clinic conseille d’appeler un professionnel de santé si le vert dure plus de quelques jours, chez vous ou chez votre enfant, et de consulter sans attendre en cas de déshydratation. Les CDC américains, pour les toxi-infections alimentaires, retiennent d’autres seuils. Diarrhée de plus de trois jours, fièvre au-dessus de 38,9 °C, vomissements qui empêchent de boire, sang, signes de déshydratation.

Ces chiffres viennent de recommandations américaines. En France, le médecin traitant et le pharmacien appliquent les pratiques locales. Ils restent de bons repères pour décider d’appeler plutôt que d’attendre encore un week-end.

Appelez le 15 ou le 112 si un saignement s’accompagne d’un vertige, d’une douleur thoracique, d’un essoufflement ou d’une douleur abdominale intense, seuils d’urgence repris par MedlinePlus en 2025. Ce n’est plus une question de couleur de selle.

Un vert qui s’accompagne d’un amaigrissement, d’une perte d’appétit, de douleurs nocturnes, d’une anémie déjà connue ou d’un changement durable du rythme intestinal (selles plus fines, plus fréquentes, plus urgentes) n’est plus un épisode alimentaire. Le médecin cherchera autre chose, y compris une maladie inflammatoire ou, selon l’âge et le contexte, une lésion du côlon. Rien de tout cela ne se lit dans une seule selle verte.

Quels examens le médecin peut proposer

Le premier outil reste l’interrogatoire. Ce que vous avez mangé, les médicaments (fer, bismuth, antibiotiques, anticoagulants, AINS), la durée, la fièvre, le poids, les voyages, la crèche, l’eau de rivière. Un examen du ventre, parfois un toucher rectal, suit. Le médecin n’a pas besoin d’une photo. Il a besoin de mots précis.

Si une infection est plausible, une coproculture ou un test moléculaire multiplex sur les selles peut identifier salmonelles, norovirus, Giardia ou C. difficile. Un seul échantillon ne suffit pas toujours pour Giardia. Pour un saignement, un test de sang occulte ou un test immunochimique fécal (FIT) cherche de l’hémoglobine humaine. Un résultat positif n’est pas un cancer. Il indique qu’il faut regarder plus loin, souvent par coloscopie. Un résultat négatif n’élimine pas un saignement intermittent.

Des analyses de sang, numération, fer, tests du foie, coagulation, aident à voir une anémie, une cholestase ou un trouble de l’hémostase. Des selles pâles orientent vers une échographie, un scanner ou une IRM des voies biliaires, parfois une CPRE (cholangiopancréatographie rétrograde endoscopique) si un obstacle doit être levé. Un saignement aigu peut conduire à une fibroscopie œso-gastro-duodénale, une coloscopie, rarement une capsule ou une angiographie.

Aucun de ces examens ne se prescrit « au cas où » devant une selle verte unique. Ils se discutent quand la couleur s’accompagne d’autres signes, persiste, ou quand l’âge, une anémie, un anticoagulant ou une perte de poids modifient les priorités. Le médecin et, pour les médicaments, le pharmacien, connaissent les circuits français. Les fiches américaines citent des noms de tests et de médicaments qui ne recouvrent pas toujours l’offre locale.

Conclusion

Une selle verte est d’abord un pigment. Bile encore verte, chlorophylle, fer, microbiote bousculé par un antibiotique. Chez la plupart des personnes qui se sentent bien, la couleur revient au brun en quelques selles. Le vrai tri se fait ailleurs. Texture, durée, fièvre, sang, urines, peau, état général.

Notez ce que vous avez mangé et les médicaments des dernières quarante-huit heures, y compris le fer et un éventuel antibiotique. Regardez si les selles sont moulées, molles ou liquides, et si mucus ou sang les accompagnent. Si le vert reste inexpliqué au-delà de quelques jours, un appel au médecin traitant suffit souvent à décider s’il faut des selles au laboratoire, une prise de sang ou simplement attendre encore un peu.

N’attendez pas, en revanche, devant des selles noires goudronneuses, un saignement abondant, des vomissements de sang, un vertige ou une pâleur brutale. Le 15 ou le 112 existe pour cela. Des selles pâles avec une jaunisse ou des urines très foncées méritent aussi une place rapide au cabinet ou aux urgences. La couleur est un indice. Ce n’est pas un diagnostic, et aucun texte en ligne ne remplace l’examen de la personne qui est devant vous.

Sources

1. Stool color: When to worry. Mayo Clinic, 10 octobre 2024.
2. Green stool – Causes and definition. Mayo Clinic, 2 juillet 2024.
3. Stool (Poop) Color: Guide, What It Indicates, Healthy Color. Cleveland Clinic, 11 février 2025.
4. LeWine HE : Green poop: What stool color can indicate about health. Harvard Health Publishing, 1er avril 2024.
5. Gastrointestinal bleeding. MedlinePlus, 24 janvier 2025.
6. Stools – pale or clay-colored. MedlinePlus, 12 août 2024.
7. Symptoms of Salmonella Infection. Centers for Disease Control and Prevention, 4 octobre 2024.
8. Food Poisoning Symptoms. Centers for Disease Control and Prevention, 24 novembre 2025.
9. Antibiotic-associated diarrhea. Mayo Clinic, 20 septembre 2025.
10. Hall B, Levy S et al. : BilR is a gut microbial enzyme that reduces bilirubin to urobilinogen. Nature Microbiology, 3 janvier 2024.
11. Blake MR, Raker JM, Whelan K : Validity and reliability of the Bristol Stool Form Scale in healthy adults and patients with diarrhoea-predominant irritable bowel syndrome. Alimentary Pharmacology & Therapeutics, octobre 2016.
12. Symptoms of Giardia Infection. Centers for Disease Control and Prevention, 20 décembre 2023.