Une nouvelle étude réalisée par un consortium de recherche américain a découvert qu’un petit segment du chromosome 16 est manquant ou dupliqué chez environ 1% des personnes atteintes d’un trouble du spectre autistique (TSA). Ce qui est surprenant à propos de cette découverte particulière est que l’omission ou la duplication n’est pas héritée d’un parent mais semble se produire spontanément, peut-être au moment de la conception.
L’étude est publiée dans le premier numéro en ligne du New England Journal of Medicine (NEJM) le 9 janvier et est l’œuvre du Autism Consortium, qui regroupe 14 grandes universités et centres médicaux de Boston, dans le Massachusetts.
Les troubles du spectre autistique (TSA) sont diagnostiqués chez un enfant sur 150 âgé de moins de trois ans. Les symptômes varient de légers à graves et ont des composantes sociales, cognitives et comportementales.
La fréquence de 1% est comparable à un certain nombre d’autres syndromes génétiques qui ont été liés aux TSA, ont indiqué les chercheurs. En outre, environ 90% des TSA sont censés avoir une composante génétique, mais jusqu’à présent, seulement 10% des cas peuvent être liés à des syndromes génétiques et chromosomiques connus.
Le Dr Mark Daly, qui travaille au Centre de recherche en génétique humaine du Massachusetts General Hospital (MGH), et chercheur principal de l’équipe de découverte de gènes de l’étude, a déclaré:
« Alors que les études épidémiologiques indiquent une très grande composante génétique de l’autisme, on sait peu de choses sur la façon dont les gènes spécifiques sont impliqués. »
Daly est membre du Autism Consortium et est professeur adjoint de médecine à la Harvard Medical School et membre du Broad Institute de Harvard et du Massachusetts Institute of Technology.
« Nous sommes encore loin de comprendre comment cette délétion ou duplication chromosomique augmente le risque d’autisme, mais c’est une première étape cruciale de cette connaissance », a ajouté Daly.
Les scientifiques étaient déjà au courant de plusieurs délétions ou duplications chromosomiques liées aux TSA, y compris un type particulier de délétion sur le chromosome 15 qui est transmis d’un parent. Donc, dans cette étude, les chercheurs ont décidé d’effectuer un balayage complet du génome.
Ils ont utilisé des échantillons de l’Autism Genome Research Exchange, qui contient de l’ADN de familles ayant au moins un enfant atteint de TSA.
Les chercheurs ont analysé plus de 1 400 échantillons d’individus atteints de TSA et un nombre similaire de parents non affectés. Ils ont trouvé qu’une région particulière du chromosome 16 a été supprimée chez 5 des individus avec un TSA, mais pas chez aucun de leurs parents. Cela suggère que la suppression s’est produite spontanément et qu’elle n’a pas été héritée.
Daly et ses collègues ont confirmé ces résultats en examinant les données cliniques d’un groupe distinct de près de 1 000 patients ayant fréquenté l’hôpital pour enfants de Boston, dont environ la moitié avait reçu un diagnostic de TSA ou d’un trouble apparenté.
Parmi ceux avec un TSA ou un trouble apparenté, ils ont trouvé 5 enfants avec la même délétion du chromosome 16, et 4 autres enfants où le segment chromosomique n’était pas supprimé mais dupliqué. Ces défauts chromosomiques n’étaient pas présents dans l’ADN des enfants qui n’avaient pas reçu un diagnostic de TSA ou de trouble apparenté.
Les résultats ont été confirmés par un autre ensemble de données obtenues auprès de deCODE Genetics, une société biopharmaceutique en Islande qui utilise des populations pour identifier des gènes humains liés à des maladies communes. Ils ont trouvé la même suppression chez 3 sur près de 300 personnes atteintes de TSA, ainsi que dans certains échantillons de personnes ayant des troubles psychiatriques ou du langage. La suppression a été trouvée dans seulement 2 des 20 000 membres de la base de données DECODE qui n’avaient pas été diagnostiqués avec un trouble associé.
Une analyse plus approfondie des données de deCODE a suggéré que, bien que cette délétion chromosomique soit probablement présente dans seulement 0,01% de la population générale, elle était 100 fois plus susceptible d’être trouvée chez les personnes atteintes d’un TSA.
Daly a expliqué que:
«Ces délétions chromosomiques non héréditaires de grande taille sont extrêmement rares. Trouver la même délétion chez un si grand nombre de patients suggère donc qu’il s’agit d’un facteur de risque très important pour l’autisme.
« Nous poursuivons maintenant des études génétiques plus détaillées pour déterminer quels gènes dans cette région sont responsables de cet effet afin d’avoir une meilleure compréhension de la biologie sous-jacente et des indices potentiels d’approches thérapeutiques », a-t-il ajouté.
Dans un éditorial d’accompagnement, les Drs Evan E. Eichler, du Howard Hughes Medical Institute et du Département de Génome Sciences, Université de Washington, Seattle, et Andrew W. Zimmerman, du Kennedy Krieger Institute et de l’Université Johns Hopkins, Baltimore, ont écrit que la découverte de la délétion spontanée ou de la duplication d’un segment d’un chromosome annonce un nouveau « paradigme » dans la recherche génétique des TSA. Les exemples cités dans cette étude pourraient être la « pointe de l’iceberg ».
« Une plus grande collection d’échantillons et de nouvelles techniques génomiques rentables peuvent être nécessaires pour éplucher les couches restantes de l’oignon », écrit Eichler et Zimmerman.
Ce type de découverte de la délétion et de la duplication des chromosomes a également des implications cliniques immédiates, selon un communiqué publié par le AutismConsortium plus tôt cette semaine.
Un nouveau type de test appelé la puce à ADN chromosomique est maintenant utilisé dans les milieux cliniques. Cela permet de détecter la délétion et la duplication des chromosomes chez les patients non diagnostiqués et leurs parents et aide les cliniciens à évaluer le risque de récidive lors des grossesses ultérieures, ce qui inquiète de nombreux parents.
Mais les tests sont coûteux et pas toujours couverts par l’assurance. Les chercheurs du Consortium travaillent sur les moyens de réduire ainsi les coûts, par exemple bydeveloping un test simple pour détecter le chromosome spécifique 16 faille.
« Association entre Microdélétion et Microduplication à 16p11.2 et Autisme.
Weiss, Lauren A., Shen, Yiping, Korn, Joshua M., Arking, Dan E., Miller, David T., Fossdal, Ragnheidur, Saemundsen, Evald, Stefansson, Hreinn, Ferreira, Manuel AR, Vert, Todd, Platt , S. Ora’h, Ruderfer, Douglas M., Walsh, Christopher A., Altshuler, David, Chakravarti, Aravinda, Tanzi, Rudolph E., Stefansson, Kari, Santangelo, Susan L., Gusella, James F., Sklar, Pamela , Wu, Bai-Lin, Daly, Mark J., le consortium de l’autisme.
N Engl J Med, publié en ligne le 9 janvier 2008, en impression le 14 février 2008.
DOI: 10.1056 / NEJMoa075974.
Cliquez ici pour l’article.
« Un point chaud de l’instabilité génétique dans l’autisme.
Evan E. Eichler et Andrew W. Zimmerman.
N Engl J Med, publié en ligne le 9 janvier 2008, en impression le 14 février 2008.
DOI: 10.1056 / NEJMe0708756.
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Sources: communiqué de presse NEJM, article de journal et éditorial, communiqué de presse du Autism Consortium.
Écrit par: Catharine Paddock
